1919 yılında Anadolu´ya geçerek Türk Kurtuluş Savaşı´na katılan Zeki Doğan, Büyük Taarruz sırasında komutası altındaki 14. Süvari Alayı ile birlikte İzmir´e giren ilk Türk komutanlarından biri olmuş, 15 Mayıs 1924 tarihinde hava sınıfına geçmiş ve 1944 tarihinde Türk Hava Kuvvetleri´nin ilk komutanı olarak atanmıştır.